Capacidades

  • Software | PREMER: inferencia rápida en redes con teoría da información

    PREMER (Parallel Reverse Engineering with Mutual information & Entropy Reduction [enxeñaría inversa paralela con información mutua e redución de entropía]) é unha ferramenta de software multiplataforma de código aberto para inferencia de estruturas de redes a partir de datos mediante medidas de teoría da información. É unha ferramenta de uso xeral desenvolvida pensando en redes biolóxicas, pero pódese aplicar a outros campos.

    Podes atopar máis información aquí.

     

  • Software | BioPreDyn-bench: paquete de problemas de referencia para modelaxe dinámica en bioloxía de sistemas

    BioPreDyn-Bench é un paquete de problemas de referencia para modelaxe dinámica en bioloxía de sistemas. Actualmente contén seis problemas complexos de estimación de parámetros que aspiran a servir de casos de proba de referencia neste eido. Este paquete inclúe modelos cinéticos a media e grande escala de células de E. coli, S. cerevisiae, D. melanogaster, ovario de hámster chinés (CHO) e unha rede de sinalización xenérica. O nivel de descrición inclúe o metabolismo, a transcrición, a transdución de sinais e o desenvolvemento.

    Podes atopar máis información aquí.

  • Software | MIDER: kit de ferramentas para inferencia en redes mediante distancia de información mutua e redución da entropía

    MIDER (distancia de información mutua e redución de entropía) é una ferramenta de software de uso xeral para inferir estruturas de redes. Desenvolveuse pensando en redes biolóxicas, pero pode aplicarse a outros campos.

    Podes atopar máis información aquí.

     

  • Software | MEIGO: kit de ferramentas multiplataforma para optimización global mediante metaheurística

    MEIGO é un kit de ferramentas para optimización global que inclúe unha serie de métodos metaheurísticos, así como un método de inferencia bayesiana para estimación de parámetros.

    Podes atopar máis información aquí.

  • Software | Kit de ferramentas SSm GO: procura dispersa para optimización global en Matlab

    SSm GO é un kit de ferramentas en Matlab con varios algoritmos de optimización global para problemas de optimización non lineais (NLP e MINLP) que utilizan procura dispersa.

    Podes atopar máis información aquí.

Proxectos activos