El departamento estudia cómo funciona el océano desde el punto de vista físico, químico y biológico, poniendo el foco en los ciclos biogeoquímicos, su papel en el cambio global y el comportamiento del fitoplancton. Su trabajo abarca desde la biogeoquímica marina hasta la geoquímica orgánica y la fotobiología y toxinología del fitoplancton. Además, cuenta con valiosas series temporales, que van desde las rías gallegas hasta el Océano Atlántico y son clave para entender la evolución de estos sistemas.

Jefe de departamento: Elvira Abollo Rodríguez

Este departamento estudia la estructura, el funcionamiento y la conservación de los ecosistemas marinos y costeros, integrando dimensiones biológicas, ecológicas y sociales. Sus grupos de investigación abarcan la ecología y biodiversidad marina, la ecología marina integrada y las ciencias sociales aplicadas a la gestión de los recursos marinos y costeros. El departamento contribuye con evidencia científica a la gestión pesquera, la conservación de la biodiversidad y la gobernanza de los sistemas costeros.

Jefe de departamento: Josep Rotllant Moragas

La investigación en este departamento aborda las bases moleculares y fisiológicas de los organismos acuáticos, con especial atención a la biotecnología, la inmunología, la genómica, la genética  y las enfermedades en especies marinas. Sus grupos trabajan en biotecnología acuática, ecofisiología de bivalvos y gestión sostenible, inmunología y genómica, y patobiología molecular marina. El departamento impulsa tanto la investigación fundamental como su aplicación directa a la producción acuícola sostenible.

Jefe de departamento: Isabel Medina Méndez

La investigación en este ámbito aborda la calidad, la seguridad, la trazabilidad y la valorización de los productos alimentarios marinos, integrando bioquímica, microbiología e ingeniería de bioprocesos. Sus cinco grupos trabajan en biosistemas e ingeniería de bioprocesos, química de productos marinos, bioquímica de alimentos, microbiología y tecnología de productos marinos, y reciclaje y valorización de residuos. El departamento conecta la investigación fundamental con la industria de los productos del mar y los objetivos de la economía circular.