Capacidades

  • Software | PREMER: inferencia rápida en redes con teoría de la información

    PREMER (Parallel Reverse Engineering with Mutual information & Entropy Reduction [ingeniería inversa paralela con información mutua y reducción de entropía]) es una herramienta de software multiplataforma de código abierto para inferencia de estructuras de redes a partir de datos mediante medidas de teoría de la información. Es una herramienta de uso general desarrollada pensando en redes biológicas, pero puede aplicarse a otros campos.

    Puedes encontrar más información aquí.

     

  • Software | BioPreDyn-bench: paquete de problemas de referencia para modelado dinámico en biología de sistemas

    BioPreDyn-Bench es un paquete de problemas de referencia para modelado dinámico en biología de sistemas. Actualmente contiene seis problemas complejos de estimación de parámetros que aspiran a servir de casos de prueba de referencia en este campo. Este paquete incluye modelos cinéticos a media y gran escala de células de E.coli, S. cerevisiae, D. melanogaster, ovario de hámster chino (CHO) y una red de señalización genérica. El nivel de descripción incluye el metabolismo, la transcripción, la transducción de señales y el desarrollo.

    Puedes encontrar más información aquí.

  • Software | MIDER: kit de herramientas para inferencia en redes mediante distancia de información mutua y reducción de la entropía

    MIDER (distancia de información mutua y reducción de entropía) es una herramienta de software de uso general para inferir estructuras de redes. Se ha desarrollado pensando en redes biológicas, pero puede aplicarse a otros campos.

    Puedes encontrar más información aquí.

     

  • Software | MEIGO: kit de herramientas multiplataforma para optimización global mediante metaheurística

    MEIGO es un kit de herramientas para optimización global que incluye una serie de métodos metaheurísticos, así como un método de inferencia bayesiana para estimación de parámetros.

    Puedes encontrar más información aquí.

  • Software | Kit de herramientas SSm GO: búsqueda dispersa para optimización global en Matlab

    SSm GO es un kit de herramientas en Matlab con varios algoritmos de optimización global para problemas de optimización no lineales (NLP y MINLP) que utilizan búsqueda dispersa.

    Puedes encontrar más información aquí.

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