Capacidades y productos de innovación

Caracterización y medida de respuestas microfisiológicas de marcadores moleculares generados en respuesta a las condiciones medioambientales para el desarrollo de un sistema de alerta temprana de alteraciones medioambientales.

Desarrollo de herramientas específicas para espacios concretos que permitan la evaluación, gestión y toma de decisiones basada en el modelado de los impactos de escenarios ambientales actuales y posibles escenarios futuros (contaminación, cambio climático, etc.) sobre las condiciones oceanográficas, la distribución de la biodiversidad, la respuesta fisiológica o el desempeño de las pesquerías y la acuicultura.

AMIGO2 es un kit de herramientas multiplataforma basado en MATLAB diseñado para resolver problemas de optimización matemática básicos para la biología de sistemas, dentro del contexto de la identificación de modelos paramétricos, la hipótesis subyacente al desarrollo de modelos y el control óptimo de los sistemas biológicos para alcanzar el comportamiento deseado de forma sintética.

Puedes encontrar más información aquí.

Método descrito en: Exler, O., L.T. Antelo, J.A. Egea, A.A. Alonso and J.R. Banga (2008) A Tabu search-based algorithm for mixed-integer nonlinear problems and its application to integrated process and control system design. Computers & Chemical Engineering, 32(8):1877-1891.

El software está disponible bajo petición (escríbenos si te interesa).

Modelado a múltiples escalas para flexibilizar la toma de decisiones y optimizar procesos complejos (p. ej., esterilización) basado en el control de la seguridad y calidad de los productos alimentarios mediante técnicas no invasivas (sensores de software, etc.).

Estudios sobre la estructura del genoma de organismos marinos, incluido el mapeo genético, la secuenciación de ADN, cómo se produce el conjunto completo de tránscritos de ARN por el genoma y cómo se ve afectado por el desarrollo, las enfermedades o los factores ambientales que determinan el fenotipo, especialmente la proteómica y la metabolómica, utilizando siempre las técnicas más avanzadas (ATAC-seq, MethylCap-Seq, RNA-seq, tecnología de ADN recombinante, CRISPR/Cas9 knockin y knockout , enhancer detector (ZED),tecnologías transgénicas Tol2 kit y BAC, etc.).

Optimización de sistemas de cultivo multitrófico en infraestructuras de acuicultura abiertas y cerradas, desde los sistemas de recirculación en acuicultura de peces y macroalgas, con especial interés en el efecto de los microbiomas resultantes sobre el bienestar animal, hasta el ajuste de sistemas de acuicultura de múltiples especies de bajo nivel trófico en el océano.

PREMER (Parallel Reverse Engineering with Mutual information & Entropy Reduction [ingeniería inversa paralela con información mutua y reducción de entropía]) es una herramienta de software multiplataforma de código abierto para inferencia de estructuras de redes a partir de datos mediante medidas de teoría de la información. Es una herramienta de uso general desarrollada pensando en redes biológicas, pero puede aplicarse a otros campos.

Puedes encontrar más información aquí.

El método se describe en Schlater, M., J. A. Egea y J. R. Banga (2009). Extended ant colony optimization for non-convex mixed integer nonlinear programming. Computers & Operations Research 36(7): 2217-2229.

El software está disponible bajo petición (escríbenos si te interesa).

Dispositivo para monitorizar el estado fisiológico de hasta 64 bivalvos en su sistema de cultivo en tiempo real. 

El sistema de monitorización se basa en el análisis de los micromovimientos de los bivalvos relacionados con la apertura de valvas (valvometría). Estudios recientes han confirmado que esta es una técnica muy prometedora para detectar proliferaciones de algas nocivas y episodios de acidificación del océano.

El prototipo está actualmente en adaptación para mejorar su portabilidad y autonomía. Para más información, escríbenos un correo electrónico.