JAE Intro 2022 | Até o 7/11 | Para grao e máster

Supervisa: Jose Luis Garrido Valencia

Grupo: Fotobiología y Toxinología de Fitoplancton

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0010

Contacto: garrido@iim.csic.es

Las microalgas son un grupo heterogéneo de organismos eucariotas unicelulares que han evolucionado, considerando su composición pigmentaria, en dos grandes linajes, denominados genéricamente verde y rojo.

La extraordinaria haptophyta picoplanctónica Picocystis salinarum incorpora pigmentos característicos de ambos linajes, en un aparato fotosintético en el que coexisten Clorofila b y Violaxantina (típicos de algas verdes) con los carotenoides Diatoxantina, Aloxantina y Monadoxantina (característicos de la línea roja). Poco se sabe del papel de estos pigmentos en la fotofisiología (fotocaptación, fotoprotección) de esta especie.

Los ciclos de xantofila (XC) han demostrado ser los principales contribuyentes a la fotoaclimatación de los organismos fotosintéticos marinos. En este proyecto formativo se estudiará un hasta ahora desconocido XC que parece operar en P. salinarum involucrando a las xantofilas Monadoxantina y Diatoxantina .

Para ello, P. salinarum se cultivará en condiciones controladas de luz (intensidad, calidad y fotoperiodo) y temperatura. Se tomarán muestras de cultivos a luz alta y a luz baja (y tras la transición entre estas condiciones lumínicas), la densidad celular se estimará por citometría de flujo y el rendimiento fotosintético se monitorizará por fluorescencia de pulsos de amplitud modulada (PAM). Los pigmentos se identificarán y cuantificarán por cromatografía líquida (HPLC) acoplada a espectroscopía visible y a espectrometría de masas (HPLC-MS). Será preciso desarrollar nuevos métodos cromatográficos adaptados a la especial composición pigmentaria de la especie.

El becario se familiarizará, en general, con todas las etapas del trabajo de investigación (exploración bibliográfica, conocimiento del estado de la temática, formulación de hipótesis, trabajo experimental, interpretación de resultados y redacción de publicaciones) y, en particular, se aproximará a técnicas y procedimientos de cultivo de microalgas, microscopía, citometría de flujo, trabajo de laboratorio con pigmentos fotosintéticos (extracción y análisis bajo condiciones específicas), HPLC (-MS), espectroscopías visible y de fluorescencia y PAM.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Más información: Para ver trabajos similares, pueden consultarse los artículos citados en Fitopasión, las citas de la Roscoff Culture Collection o el estudio de Garrido et al. (2016).

Supervisa: Miriam Rodríguez García

Grupo: Biosistemas e Ingeniería de Bioprocesos (Bio2Eng)

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0200

Contacto: miriamr@iim.csic.es

La limpieza y desinfección de alimentos es un proceso crítico para garantizar seguridad alimentaria. Alimentos de IV gama como frutas y verduras suelen consumirse sin ningún tratamiento térmico de cocinado, lo que obliga a asegurar una correcta inactivación de los posibles patógenos en el alimento. Un problema similar se da, por ejemplo, en la depuración de moluscos como el mejillón.

Estos procesos de limpieza y desinfección, sin embargo, son diseñados en la industria a base de experimentación, sin ayuda de modelos que puedan ser optimizados para encontrar los parámetros de operación óptimos. Un ejemplo de optimización interesante es el minimizar la dosificación de higienizante que asegure inactivación de los patógenos. Este reto radica en la gran complejidad de los modelos necesarios, que deben combinar dinámica de fluidos con dinámica de inactivación de patógenos.

En este trabajo se pretende modelar mediante dinámica de fluidos un tanque de limpieza con o sin higienizante que luego se simulará, o incluso optimizará, para obtener los mejores parámetros de operación para garantizar seguridad alimentaria. El modelo se implementará en Comsol, asegurando una correcta resolución numérica. La optimización se hará bien simulación en Comsol o mediante la generación de datos que puedan ser utilizados para desarrollar un modelo de orden reducido en MATLAB que luego sea optimizado. En este último caso se probarán tanto el uso de optimizadores locales en MATLAB como fmincon como globales basados en algoritmos genéticos como Differential Evolution.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Juan Severino Pino Ibanhez

Grupo: Laboratorio de Geoquímica Orgánica

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0321

Contacto: jseverino@iim.csic.es

Los radioisótopos se producen de forma natural en rocas y sedimentos, por lo que las aguas en contacto con estos compartimentos están naturalmente enriquecidas en estos compuestos. Así, los radioisótopos pueden ser utilizados como trazadores para el estudio de diversos aspectos de difícil identificación pero relevantes para la oceanografía costera, como son la descarga de aguas subterráneas, la circulación costera, el acoplamiento bentónico-pelágico y la reactividad biogeoquímica. Encuadrado en los proyectos recientemente financiados UNDERGROUND (Planes Complementarios en Ciencias Marinas de Galicia) e INTEGROUNDS (Plan estatal 2021-2023), desarrollaremos un sistema de medición de radioisótopos en continuo que se utilizará para realizar determinaciones durante la navegación por la costa de la Ría de Vigo. El sistema permitirá medir estos compuestos con alta resolución espacial nunca antes realizadas en la costa atlántica española. Los resultados de estos muestreos permitirán identificar las zonas afectadas por la descarga de aguas subterráneas y de intensa interacción sedimento-agua, permitiendo además obtener información novedosa sobre la circulación costera en las zonas someras de la ría. La recogida en paralelo de muestras discretas para el análisis de compuestos medioambientalmente significativos como son el oxígeno, nutrientes, metales, materia orgánica y gases de efecto invernadero, permitirá evaluar el impacto de la interacción continente-océano sobre la fertilización, acidificación y contaminación en la Ría de Vigo. La persona seleccionada participará en la construcción del sistema de medición de radioisótopos y en los muestreos. Adquirirá así competencia en el manejo y manipulación de los equipos de medición de radioisótopos y su aplicación en la oceanografía costera. Participará también en un muestreo por la Ría de Vigo donde realizará recogida de muestras y procesado para su posterior análisis en el laboratorio. Finalmente, adquirirá competencia en el análisis e interpretación de los resultados obtenidos mediante el uso de modelos de cajas y balances de masa, participando en la generación de resultados inéditos en la zona de estudio que serán divulgados en la comunidad científica mediante su publicación en revistas especializadas.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Sonia Dios Vidal

Grupo: Patobiología Molecular Marina

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0532

Contacto: sdios@iim.csic.es

El objetivo da la formación que se propone es evaluar el impacto del oleaje sobre un recurso natural clave como es la almeja rubia en las Rías Baixas, bajo el contexto de Cambio Climático.

La cría de moluscos en Galicia tiene un alto impacto socioeconómico tanto directo como indirecto a través de las actividades relacionadas. En este sentido, la interacción entre las corrientes de alta mar y el oleaje costero puede tener un impacto significativo en el caso de las almejas, ya que el fondo marino donde se cosechan estos moluscos puede verse significativamente perturbado. Como consecuencia, las almejas podrían estresarse lo suficiente como para hacer frente a cualquier amenaza ambiental adicional.

Para establecer la relación entre la fuerza del oleaje y la condición inmune de las almejas, se llevará a cabo una evaluación de la respuesta celular al estrés (expresión de genes de respuesta inmune y análisis de estrés oxidativo) en almejas procedentes de un banco marisquero natural y en condiciones experimentales de laboratorio. Además, se realizará un análisis histológico para la evaluación de alteraciones patológicas y/o presencia de patógenos, principalmente para la presencia y número de colonias de rickettsias, que viven de forma natural en colonias intracelulares en las branquias de las almejas, pero que pueden sufrir un crecimiento exacerbado en condiciones adversas.

El laboratorio cuenta con todo el equipamiento necesario para llevar a cabo las tareas propuestas y también con servicios específicos dentro del IIM como la Unidad de Muestreo e Imagen del Medio Marino (para el muestreo de campo); el Servicio de Citometría de Flujo (para el análisis del estrés oxidativo) y el Servicio de Historia Vital (para los procedimientos histológicos).

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Mª del Mar Costa Portela

Grupo: Patobiología Molecular Marina

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0559

Contacto: mcosta@iim.csic.es

El principal objetivo de esta propuesta es la identificación de moléculas que puedan actuar como biomarcadores reproductivos en tres de las especies de moluscos más comercializadas en Galicia: el mejillón Mediterráneo, Mytilus galloprovincialis, la almeja fina, Ruditapes decussatus, y la almeja babosa, Venerupis corrugata.

El cultivo de moluscos bivalvos constituye la principal contribución a la acuicultura en Galicia. Sin embargo, para poder mejorar la calidad de los cultivos y garantizar una producción tanto acuícola como marisquera sostenible, se hace necesario abordar cada una de las etapas del desarrollo de estos organismos, estudiando los principales parámetros fisiológicos y metabólicos que puedan estar implicados, optimizando las condiciones que permitan obtener puestas de calidad y asegurar así, la continuidad de los cultivos.

Los registros recogidos durante años de series de parámetros temporales han ayudado a la hora de determinar las condiciones óptimas para poder seguir abasteciendo de semilla a los cultivos intensivos. Sin embargo, estas series de datos temporales, además de tediosas y duraderas en el tiempo, necesitan ser complementadas con otras técnicas más rápidas y eficaces, como técnicas bioquímicas (análisis de actividades enzimáticas y metabolitos), moleculares (análisis de la expresión génica y su cuantificación) e inmunohistoquímicas (estudio de la localización y expresión de genes y proteínas de interés), que permitan identificar moléculas que sirvan como biomarcadores de cada una de las etapas del ciclo de cultivo (desde las semillas hasta los adultos).

Las principales actividades a realizar en la presente propuesta se centrarán en el análisis de muestras procedentes de diferentes estadios de desarrollo gonadal y en la búsqueda de genes expresados de manera diferencial en cada una de ellas, con el objetivo de seleccionarlos como biomarcadores del estado gonadal de estos organismos. También se llevarán a cabo técnicas de hibridación in situ e inmunohistoquímica para aquellas moléculas con un mayor índice de expresión diferencial.

El laboratorio cuenta con todo el equipamiento necesario para llevar a cabo las tareas propuestas de biología molecular y también con servicios específicos dentro del IIM como el Servicio de Acuarios (para el mantenimiento y cuidado de los animales) y el Servicio de Historia Vital (para la preparación de muestras histológicas).

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Jose Fernández Babarro

Grupo: Ecofisiología, Biomarcadores y Gestión Sostenible de Bivalvos (EsMaBa)

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0578

Contacto: jbabarro@iim.csic.es

El objetivo del Plan de Formación es promover e incentivar la participación de nuevos candidatos en la línea de investigación del grupo de Ecofisiología, Biomarcadores y Gestión sostenible de Moluscos Bivalvos del Instituto de Investigacións Mariñas de Vigo (IIM-CSIC).

Para ello, en el marco del desarrollo del proyecto STRAUSS y financiado por el Ministerio de Ciencia e Innovación, se plantea la oferta de formación del candidato. El proyecto lleva por título: "Efectos del oleaje en el sistema de afloramiento de las Rías Baixas: dinámica superficial en casos de estudio biológicos específicos" y la formación se orientará a los aspectos relativos a las respuestas ecofisiológicas de los moluscos bivalvos frente al cambio global, como organismos representantes de un sector de elevado impacto socioeconómico de Galicia. 

Se propondrá una formación multidisciplinar e integradora para complementar conocimientos básicos en ecofisiología marina con tecnologías novedosas (HFNI del inglés high-frequency non invasive) que permitan avanzar en el monitoring ambiental de la franja costera usando organismos marinos como centinelas del impacto de la heterogeneidad ambiental.

En concreto, se pretende afianzar los siguientes aspectos:

• Ofertar una formación multidisciplinar que al candidato le permita integrarse en temáticas complementarias de interés para abordar retos globales y que actualmente están siendo promovidas en el IIM-CSIC
• Dar formación avanzada en temáticas de interés como la ecofisiología de moluscos bivalvos, oceanografía física y sistemas de monitorización novedosos y altamente especializados
• Integrar el conocimiento desarrollado en laboratorio para la evaluación de escenarios climáticos seleccionados y explorar su potencial extrapolación y complementariedad con sistemas de monitoring ambiental clásico  
• Planificar y estudiar eventos ambientales realistas para el desarrollo de tecnologías avanzadas que permitan un impulso significativo en el análisis de respuestas de interés para el estudio del impacto del cambio global en los servicios ecosistémicos representados por el grupo de los moluscos bivalvos (biomonitoring, biorremediación, bioeconomía)

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Nicolás Villacieros Robineau

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0646

Contacto: nvrobineau@iim.csic.es

Las rías gallegas albergan una gran biodiversidad ligada en gran medida a la elevada variabilidad de ambientes costeros y de las condiciones oceanográficas existentes en su interior, asociada principalmente al grado de exposición/protección frente al oleaje exterior y a la influencia de las descargas fluviales. En esta propuesta se plantea el estudio de distribución de distintas especies bentónicas siendo muchas de ellas de elevado valor ecológico y socio-económico como los moluscos bivalvos infaunales (almejas, berberechos, navajas, etc.). El principal objetivo es comprar los patrones de distribución espacial de estas poblaciones con la variabilidad del régimen de oleaje y con la tipología del sedimento presente en dichos fondos.

El estudiante aplicará varias metodologías para comparar la distribución de las poblaciones de especies bentónicas con la hidrodinámica ligada al oleaje dentro de las rías. Para ello utilizará sistemas de información geográfica (GIS) para integrar la información existente en las bases de datos oficiales y en publicaciones científicas centrándose en la localización de las poblaciones de interés y en la tipología del sedimento de dichas zonas. Complementariamente, se familiarizará con la extracción y análisis de salidas de modelos numéricos de oleaje mediante lenguaje de programación tipo Matlab para obtener variables de altura y periodo de ola. Por último, mediante técnicas estadísticas buscará posibles correlaciones espaciales entre los patrones de distribución de las especies y la variabilidad en la hidrodinámica y tipo de sedimento.

El resultado esperable es la obtención de un primer atlas biogeográfico bentónico de gran novedad e importancia, tanto para el sector científico como para el productivo marisquero, que ayude a entender la variabilidad de estas poblaciones y mejore la gestión de estos servicios ecosistémicos de alto interés.

Durante el periodo de formación el estudiante podrá también familiarizarse con el trabajo del Departamento de Oceanografía en el que se realizan campañas de campo, preparación de fondeos instrumentales, análisis de laboratorio y procesado de datos meteo-oceanográficos. Actualmente, el investigador tutor es el responsable de un subproyecto de los Planes Complementarios de Ciencias Marinas de Galicia sobre la implantación de una nueva tecnología de observación basada en perfiladores verticales (ProCoast) en cuya configuración y puesta en funcionamiento podrá colaborar el alumno.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Carmen González Castro

Grupo: Procesos Oceánicos en Cambio Global

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0747

Contacto: cgcastro@iim.csic.es

Aproximadamente la mitad de toda la producción primaria del globo tiene lugar en el océano, donde el fitoplancton o conjunto de algas microscópicas que flotan libremente en la superficie del mar, son los principales responsables de la fijación fotosintética de carbono. La producción de oxígeno y materia orgánica fotosintetizada viene condicionada por la estructura y composición de la comunidad fitoplanctónica.

Así, se conoce que el fitoplancton de pequeño tamaño domina en zonas oligotróficas del océano, en donde la fijación de carbono se encuentra limitada por la disponibilidad de nutrientes y la materia orgánica fotosintetizada se destina al mantenimiento de la comunidad planctónica microbiana. En estas aguas, la comunidad microbiana tiende hacia el balance metabólico entre producción y respiración, debido a la baja producción primaria y la relativa mayor importancia de la respiración bacteriana.  Por el contrario, en zonas costeras, la elevada disponibilidad de nutrientes permite altos niveles de producción primaria, atribuibles al fitoplancton de mayor tamaño. Estas zonas suelen presentar un balance metabólico netamente autotrófico y con exceso de materia orgánica, potencialmente transferible a niveles tróficos superiores. No obstante, esta dicotomía falla a escalas más pequeñas, dada la elevada variabilidad ambiental muy especialmente en zonas de afloramiento costero. Los episodios de afloramiento y relajación típicos introducen una gran variabilidad en el aporte de nutrientes, determinando que la comunidad planctónica microbiana fluctúe entre la propia de mares oligotróficos y la de mares eutróficos, pasando por diferentes situaciones posibles entre estas dos extremas.

En el afloramiento del Noroeste de la península Ibérica varios estudios muestran la existencia de una gran variedad de comunidades planctónicas microbianas asociadas a diferentes condiciones ambientales. No obstante, casi todos estos estudios están dirigidos a caracterizar la variabilidad temporal. En este estudio se propone determinar la variabilidad espacial, mediante observaciones con dos boyas de deriva; una lanzada cerca de la costa, donde el aporte de nutrientes es elevado, y otra siguiendo agua oceánica con pocos nutrientes. En ambos ambientes se caracterizará la estructura, composición y metabolismo de las comunidades planctónicas microbianas. El Dr. Francisco G. Figueiras colaborará en la dirección de este trabajo con potencialidad de TFG o TFM.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Beatriz Novoa García

Grupo: Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0839

Contacto: beatriznovoa@iim.csic.es

El objetivo del proyecto es estudiar las bases moleculares de la respuesta antiviral empleando como modelo el pez cebra (Danio rerio). Pretendemos entender cómo aspectos intrínsecos del organismo como la inflamación o el microbioma pueden afectar a la resistencia frente a enfermedades virales. El alumno empleará herramientas de biología celular e inmunología y también herramientas transcriptómicas (RNA seq) y varias herramientas bioinformáticas para analizar la modulación de la respuesta inflamatoria y antiviral de macrófagos y neutrófilos frente a infecciones. Se estudiará el papel de diferentes genes en la respuesta inmune innata, principalmente aquellos con relevancia en enfermedades inflamatorias humanas, mediante bloqueo transitorio o incremento de su expresión.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Jorge Hernández Urcera

Grupo: Ecología y Recursos Marinos

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_0909

Contacto: jurcera@iim.csic.es

El plan de formación está enfocado en el estudio de la ecología y comportamiento de cefalópodos en su hábitat natural. El alumno tendrá la oportunidad de abordar diferentes aspectos de la ecología de los cefalópodos, una clase de animales con una excepcional capacidad para desarrollar una amplia gama de comportamientos. Su impresionante capacidad neuronal modula estratégicamente el cerebro, los brazos y la piel, configurando un comportamiento sincronizado que permite a estos invertebrados encontrar la mejor manera de sobrevivir y perpetuar la especie. Muchos de estos comportamientos, que juegan un papel clave en la ecología de estas especies, ya han sido descritos, pero muchos otros están a la espera de ser descubiertos.

Recientemente, la ciencia ciudadana ha adquirido un papel fundamental para abordar cuestiones de investigación inalcanzables a través de proyectos científicos convencionales. Aprovechando esta nueva ventana de investigación, y bajo el paraguas de la plataforma CEPHALOPOD CITIZEN SCIENCE PROJECT (coordinada en España por el Dr. Hernández-Urcera) hemos potenciado y aumentado exponencialmente nuestra capacidad para conseguir material audiovisual (vídeo/fotografía) con el que explorar comportamientos de cefalópodos que permanecen ocultos en el ámbito marino.

Actualmente contamos con la colaboración de varios científicos ciudadanos nacionales e internacionales, principalmente buceadores recreativos y fotógrafos submarinos, que nos han proporcionado material audiovisual de alto valor científico para explicar interesantes comportamientos de sepias, pulpos y calamares. Por medio de la curación y tratamiento de estos datos, el estudiante abordará diferentes aspectos de la ecología y el comportamiento de estas especies, como la cópula, la depredación, las relaciones interespecíficas, etc. El objetivo del plan de formación es el análisis de toda esta información para situarla en un contexto ecológico, pudiendo así definir las estrategias utilizadas por estos animales para sobrevivir en un medio tan hostil.

El proyecto formativo constará de tres etapas: a) visualización y curación del banco de imágenes de cefalópodos y b) análisis de la información relevante registrada y c) definición de nuevos comportamientos de las especies estudiadas. Los resultados del proyecto formativo podrían dar lugar a publicaciones científicas, que repercutirían de forma notable en la formación del estudiante.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Lucía Méndez López

Grupo: Química de Productos Marinos

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1402

Contacto: luciamendez@iim.csic.es

Los lípidos de la dieta son componentes claves en la progresión de la inflamación y el envejecimiento cerebral. La investigación actual sobre el papel de los alimentos de origen marino en la salud mental se centra, por ello, en el consumo de los lípidos de origen marino, especialmente de ácidos grasos poliinsaturados omega-3 (PUFA n-3), para mejorar la inflamación, el estrés oxidativo y prevenir el envejecimiento celular. Nuestra línea de investigación sobre "Biomarcadores dietéticos para un envejecimiento saludable" tiene como objetivo comprender el efecto beneficioso que la ingesta de dietas ricas en productos de origen marino puede ejercer durante el envejecimiento y la aparición de enfermedades asociadas al mismo, con especial énfasis en su efecto sobre la neuroinflamación.

El proyecto de formación del candidato supondrá una inmersión en las aplicaciones de Cromatografía Líquida acopladas a Espectrometría de Masas, para abordar la influencia de las dietas ricas en lípidos de origen marino sobre la formación de mediadores lipídicos oxidativos, que son compuestos con potencial para resolver la inflamación en el cerebro de modelos animales de envejecimiento. El candidato se formará en diversas metodologías basadas en Espectrometría de Masas de última generación y se integrará en un grupo interdisciplinar de personas con formación en química, bioquímica y clínica. El grupo proporcionará al candidato las condiciones necesarias para llevar a cabo su plan de formación y las actividades de investigación propuestas, en un ambiente de trabajo y cooperación positivo y agradable.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Patricia Pereiro González

Grupo: Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1408

Contacto: patriciapereiro@iim.csic.es

En este plan de trabajo se pretende estudiar las bases de la posible implicación del metabolismo, y por consiguiente de distintos metabolitos, en la respuesta inmune de peces de interés comercial como son el rodaballo y la lubina. Se formará al interesado en técnicas de secuenciación masiva y análisis metabolómicos, que son la base para identificar las rutas y metabolitos implicados en la respuesta inmune o en la mayor o menor resistencia a enfermedades infecciosas, y se llevarán a cabo ensayos funcionales orientados a testar el posible efecto inmunomodulador de distintos metabolitos, hormonas metabólicas, o compuestos reguladores del metabolismo. Se hará también uso de la especie modelo pez cebra (Danio rerio) para screening preliminar de potenciales compuestos candidatos para posteriormente aplicar a las especies comerciales. Se realizarán análisis bioinformáticos, técnicas de biología molecular (extracción de ácidos nucleicos, síntesis cDNA, PCR en tiempo real...) y técnicas de microscopía, entre otras.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Antonio Figueras Huerta

Grupo: Inmunología y Genómica

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1411

Contacto: antonio.figueras@iim.csic.es

La resistencia a las enfermedades del mejillón contrasta con las frecuentes mortalidades que experimentan otros bivalvos que viven en los mismos lugares. Estudiaremos el microbioma asociado a esta especie para determinar los patógenos potenciales no identificados por otras herramientas clásicas de diagnóstico e investigar la diversidad microbiana del medio marino costero ya que, por su actividad filtradora, estos animales están en contacto directo con el microbioma del medio marino.

El estudiante aprenderá a trabajar con datos de secuenciación masiva así como a aplicar herramientas de bioinformática para determinar la riqueza o la composición de bacterias en estos organismos.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Josep Rotllant Moragas

Grupo: Laboratorio de Biotecnología Acuática

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1420

Contacto: rotllant@iim.csic.es

Los microARNs circulantes (C-miARNs) son pequeñas moléculas de ARN no codificante altamente conservadas que orquestan una amplia gama de procesos biológicos a través de la regulación post-transcripcional de la expresión génica. Un aspecto interesante de la identificación de estas moléculas como biomarcadores proviene de expresión tanto temporal como espacial finamente regulada, su secreción desde las células al medio extracelular y su alta estabilidad en los fluidos corporales. Todas estas características confieren a los C-miRNA el potencial de convertirse en una valiosa herramienta no invasiva para medir el bienestar y la salud de los animales. Por tanto, existe un gran interés en el estudio de la importancia de los C-miRNAs como posibles biomarcadores para evaluar el bienestar durante los procesos de domesticación y cultivo de una determinada especie. En este trabajo pretendemos  mapear,  caracterizar y validar diferentes C-miRNAs en diferentes tejidos de la cherna (Polyprion americanus) para ser usado como biomarcadores para la evaluación del estado de salud y bienestar de esta especie en poblaciones naturales y en el proceso de domesticación y  producción en sistemas de cultivo intensivo.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Laura Casas Castaño

Grupo: Ecología y Recursos Marinos

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1437

Contacto: lauracasas@iim.csic.es

El objetivo principal de este trabajo de máster es poner a punto una innovadora metodología que permitirá obtener estimas de diversidad genética en especies marinas usando muestras de agua. El ADN ambiental de muestras de agua de mar contiene ADN de diferentes especies, pero también de diferentes individuos de una misma especie. De esta manera, ésta técnica potencialmente ofrece la posibilidad de evaluar tanto la diversidad de especies como la diversidad genética dentro de especies. En este proyecto usaremos el gen mitocondrial Citocromo C oxidasa subunidad I (COI) que ha sido ampliamente usado para análisis filogenéticos (diferentes especies), como en genética de poblaciones (diversidad genética dentro de especies). Además, actualmente se dispone de técnicas de secuenciación que permiten obtener secuencias completas (ej. PacBIO long-reads sequencing) del COI (haplotipos) y de esta manera estimas de diversidad genética de las especies contenidas en una muestra ambiental (metagenomas). El proyecto consta de una parte de trabajo de laboratorio: extracción de ADN, amplificación por PCR del COI de diferentes individuos y especies de peces que serán usados como controles; y una parte bioinformática que involucrará procesar las secuencias obtenidas de la secuenciación del ADN ambiental.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.

Supervisa: Camino Gestal Mateo

Grupo: Patobiología Molecular Marina

Área: Vida  Referencia de la oferta: JAEINT22_EX_1479

Contacto: cgestal@iim.csic.es

El objetivo general de esta propuesta es profundizar en el conocimiento del sistema inmune del pulpo común estudiando el papel de las células implicadas en la respuesta inmune (hemocitos) y las proteínas de la hemolinfa en el reconocimiento y respuesta inmune frente a lo no propio. 

El pulpo común, Octopus vulgaris, es parte de una rama evolucionada de moluscos, que presenta características más desarrolladas, como un cerebro complejo con un sistema nervioso centralizado, y un sistema circulatorio desarrollado formado por venas y arterias. Todas estas características hacen del pulpo un modelo animal invertebrado muy utilizado en diversas disciplinas, incluida las neurociencias. Sin embargo, el conocimiento del sistema inmunitario de los cefalópodos en general, y del pulpo en particular, es limitado.

El pulpo común es además, una especie comercialmente importante con un alto potencial para la diversificación de la acuicultura. Para proteger este importante recurso pesquero en Galicia, actualmente sobreexplotado, impulsar la bioeconomía mediante un uso más eficiente de los recursos vivos y abastecer la fuerte demanda del mercado, es necesario desarrollar una acuicultura eficiente y sostenible que garantice el bienestar animal. Para ello,  una de las prioridades es la prevención de enfermedades y el aumento de su capacidad de lucha contra patógenos y agresiones externas como estrategia para mejorar su salud y bienestar.

Los primeros estudios de inmunología comparada de invertebrados revelaron una inmunidad básica y limitada a respuestas de tipo innato. Sin embargo, en los últimos años se han producido avances significativos en el estudio de la competencia inmune en invertebrados que subrayan la presencia de moléculas efectoras alternativas a las del sistema inmune adaptativo, con un alto grado de diversificación para reconocer lo que no es propio, factor clave en la exitosa respuesta inmune de invertebrados. Esto, junto con la capacidad de protección contra la reinfección (o inmunidad entrenada), son conceptos que merecen más investigación para comprender cuán compleja es dicha respuesta inmune y qué moléculas están implicadas en la lucha contra enfermedades. 

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar cursando un título de Grado o Máster y cumplir con todos los requisitos contemplados en la convocatoria.