Aquatic Biotechnology Lab
Our lab studies the fundamental question of how the development of complex organisms is controlled, using turbot and zebrafish as our models.
The main scientific objective of the Aquatic Biotchenology Lab is to apply molecular and cellular approaches to studies of early development and disease in fish, as well as to apply basic science to improve the yield, performance and sustainability of marine aquaculture at the global level.
Our lab's research generally focuses on understanding how the information encoded in DNA is accurately used by cells to perform the physiological functions required during the different developmental phases.
The disruption or breakdown of these regulatory mechanisms is responsible for many developmental abnormalities, such as morphological deformities. We aim to reveal the way some of these mechanisms work, which, in turn, will help us understand the cause of the associated abnormalities. We use zebrafish (Danio rerio) and turbot (Scophthalmus maximus) as model systems.
- DES4FISH -
<p>Programa Ciencias Mariñas: Descartes pesqueiros como ingredientes para acuicultura</p>
Principal investigator:VázquezÁlvarezXosé AntónFunding body:El Programa de Ciencias Mariñas de Galicia es 1 de los 5 programas de Ciencias Marinas de los Planes Complementarios de I+D+I del Plan de Recuperación Transformación y Resilencia. Financiado por FEMP/FEMPA.Funding for IIM-CSIC:46800€Fromto - NuTec -
<p>Nuevas Tecnologías moleculares y de control remoto para la Evaluación de las poblaciones de Cetáceos</p>
Principal investigator:PierceGraham JohnRotllantMoragasJosepFunding body:Ayuda BM2019/40 financiada con la colaboración de la Fundación Biodiversidad y del Ministerio para la Transición Ecológica y el Reto Demográfico para la Conservación de la Biodiversidad Marina en EspañaFunding for IIM-CSIC:58322€Fromto - FISH_RECAP -
<p>One genome for two body plans: genome-wide functional genomic and transcriptomic approaches to understand the genetic bases of fish metamorphosis</p>
Principal investigator:RotllantMoragasJosepFunding body:Proyecto AGL2017-89648-P financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033/ y por FEDER Una manera de hacer EuropaFunding for IIM-CSIC:165000€Fromto
- Jesús Marco de Lucas; M. Victoria Moreno-Arribas; Montoliu, Lluís; Rada-Iglesias, Alvaro; Domínguez, María; Huertas Sánchez, Pablo; De Las Rivas, Javier; Rojas, A. M.; Azorín, Ferran; Rotllant, Josep; Gutiérrez Armenta, Crisanto; Hernández-Munaín, Cristina; Barco, Ángel; Gómez, María; Herrero, Antonia; Ramos, Lourdes; Fraga, Mario F.; Ramos, Sonia (2021) White Paper 3: Genome&Epigenetics Consejo Superior de Investigaciones Científicas ISBN:978-84-00-10739-0
- Guerrero-Peña, L.; Suarez-Bregua, P.; Méndez-Martínez, L.; García-Fernández, P.; Tur, R.; Rubiolo, J.A.; Tena, J.J.; Rotllant, J. (2021) Brains in Metamorphosis: Temporal Transcriptome Dynamics in Hatchery-Reared Flatfishes Biology DOI:10.3390/biology10121256
- Azorín F; Rotllant J; Albert Jordán; Ignacio Maeso; Miguel Manzanares; Álvaro Rad; Joaquim Roca; Guillermo Vicent (2021) 3D Genoma Architecture " Genome & epigenetics vol. 3" Consejo Superior de Investigaciones Científicas
- Henriques, D.; Balsa-Canto, E. (2021) The Monod Model Is Insufficient To Explain Biomass Growth in Nitrogen-Limited Yeast Fermentation Applied and Environmental Microbiology DOI:10.1128/AEM.01084-21
- Suarez-Bregua, P.; Pirraco, R.P.; Hernández-Urcera, J.; Reis, R.L.; Rotllant, J. (2021) Impact of dietary phosphorus on turbot bone mineral density and content Aquaculture Nutrition DOI:10.1111/anu.13253
- TFM - Andrielle Larissa Reascos Tatés (26/09/2022) Nuevas herramientas para la monitorización de cetáceos en el norte y noroeste de la Península Ibérica: ADN ambiental y drones UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID
- TFM - PRIYANKA SONI (15/07/2021) How Fishes Color their Skin: Genetic Analysis of Melanocortin Receptor 2 (MC2R) in Fish Pigmentation UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO (UPV/EHU )
- TFM - Lara Vidal Nogueira (04/09/2020) La arquitectura tridimensional del Genoma. Principios y funciones Univerdidad de Vigo (UVigo)
- TFM - Luis Méndez Martínez (14/07/2020) Caracterización funcional del papel del receptor de melanocortinas Mc2r en la formación del patrón de pigmentación en el pez cebra (Danio rerio) Univerdidad de Vigo (UVigo)
- TFM - Miguel Álvarez González (09/07/2020) Análisis de ADN ambiental (eDNA) y su aplicación para la monitorización de cetáceos en el Atlántico norte Universidade de Vigo (UVIGO)
<p>Optimización y bienestar del pulpo común bajo condiciones de cultivo</p>
Principal investigator:RotllantMoragasJosepFunding body:NUEVA PESCANOVA BIOMARINE CENTER SLFunding for IIM-CSIC:142428€Fromto- FishGenome -
<p>Improving Cost-Efficiency of Fisheries Research Surveys and Fish Stocks Assessments using Next-Generation Genetic Sequencing Methods</p>
Principal investigator:SaboridoReyFranFunding body:European CommisionFunding for IIM-CSIC:800000€Fromto
- Capacidades | Ómica avanzada aplicada a organismos mariños
Estudos sobre a estrutura do xenoma de organismos mariños, incluído o mapeado xenético, a secuenciación de ADN, como se produce o conxunto completo de transcritos de ARN polo xenoma e como se ve afectado polo desenvolvemento, as doenzas ou os factores ambientais que determinan o fenotipo, especialmente a proteómica e a metabolómica, utilizando sempre as técnicas máis avanzadas (ATAC-seq, MethylCap-Seq, RNA-seq, tecnoloxía de ADN recombinante, CRISPR/Cas9 knockin e knockout , enhancer detector (ZED),tecnoloxías transxénicas Tol2 kit e BAC, etc.).
- Capacidades | Desarrollo y optimización de sistemas de acuicultura para especies de cultivo tradicionales y nuevas
Desarrollo de técnicas de cultivo integradas para nuevas especies acuícolas, así como optimización de las especies tradicionales basada en diferentes enfoques (es decir, desarrollo temprano, manipulación, alimentación, enfermedades y respuesta inmunitaria, rendimiento ecofisiológico o capacidad de carga de los ecosistemas) para mejorar el bienestar animal, el rendimiento y la eficacia de la acuicultura marina a nivel global.
- Capabilities | Development of pathogen-resistant variants for aquaculture
Application of the most advanced -omic techniques for the identification of resistance genes that can be used as biomarkers for the selection of pathogen-resistant variants of marine aquaculture species.
- Capacidades | Desenvolvemento e optimización de sistemas de acuicultura para especies de cultivo tradicionais e novas
Desenvolvemento de técnicas de cultivo integradas para novas especies de acuicultura, así como optimización das especies tradicionais baseada en diferentes enfoques (é dicir, fases iniciais do desenvolvemento, manipulación, alimentación, enfermidades e resposta inmunitaria, rendemento ecofisiolóxico ou capacidade de carga dos ecosistemas) para mellorar o benestar animal, o rendemento e a eficacia da acuicultura mariña a nivel global.
- Capacidades | Desarrollo de variedades de especies de acuicultura resistentes a patógenos
Aplicación de las más avanzadas técnicas de -ómica para identificar genes de resistencia que pueden usarse como biomarcadores para seleccionar variedades de especies de acuicultura marina que sean resistentes a patógenos.