Becas TFM | JAE Intro ICU2022

Supervisan: Miguel Gil Coto y José M. Fernández Babarro

Grupos: Procesos Oceánicos en Cambio Global; Ecofisiología, Biomarcadores y Manejo Sostenible de Bivalvos.

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-09

En el marco del proyecto de investigación STRAUSS (Efectos de las olas oceánicas en el sistema de surgencia de las Rías Baixas: dinámica de la superficie en estudios de casos biológicos seleccionados), el IIM-CSIC ha desarrollado dos dispositivos para medir el movimiento de alta frecuencia de boyas y bateas de mejillón. Ambos dispositivos electrónicos, utilizan unidades de medida inercial (IMU) implementadas en una plataforma Arduino con capacidad de registro y transmisión de datos (GPRS). Mediante este proyecto esperamos mejorar los algoritmos y el procesamiento de datos, que permitan transformar las señales IMU en parámetros que definan la ondulación del océano y los movimientos resultantes en estructuras flotantes, tanto boyas como bateas, que, en última instancia, producen desprendimientos de mejillones y problemas para el sector de la acuicultura. Nuestro objetivo es conocer los regímenes de ondulación en las Rías Baixas y su efecto en la dinámica actual, así como su impacto en el ecosistema.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de Grado en Ciencias del Mar, Ciencias Ambientales, Física, Ingeniería Industrial, Ingeniería de Telecomunicaciones o Ingeniería de Tecnologías Informáticas. Se requiere una nota mínima de 7.00 para los grados de ciencias y de 6.00 para los grados de ingeniería.

Contacto: mgilcoto@iim.csic.es; jbabarro@iim.csic.es

Supervisan: Eva Balsa-Canto y Xosé Antón Vázquez Álvarez

Grupos: Biosistemas e Ingeniería de Bioprocesos; Reciclado y Valorización de Residuos 

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-10

El objetivo principal de este trabajo de máster es desarrollar un modelo dinámico de un proceso de fermentación en el contexto del concepto de Biorrefinería Marina. Se considerará un tipo de cepa bacteriana probiótica y productora de ácido láctico. En relación a los sustratos, y en base al concepto de Biorrefinería Marina, trabajaremos con fuentes ricas en azúcares - glucosa - (como efluentes generados en la cocción industrial de mejillones) y fuentes ricas en nitrógeno orgánico - peptonas - (obtenidas de subproductos de la pesca y acuicultura). Se realizará la experimentación a escala laboratorio. Los diseños experimentales estudiarán el efecto combinado de la temperatura y diferentes concentraciones de sustratos (glucosa y peptonas) sobre la cinética del crecimiento bacteriano y la producción simultánea de metabolitos. Finalmente, adaptaremos modelos dinámicos, previamente desarrollados, para predecir y optimizar el proceso de fermentación.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de Grado en Biotecnología, Ingeniería de Bioprocesos, Bioingeniería, Ingeniería química o Bioquímica. Se requiere una nota mínima de 7.00.

Contacto: ebalsa@iim.csic.es; jvazquez@iim.csic.es

Supervisan: María del Mar Costa Portela, Camino Gestal Mateo, Mónica Carrera

Grupos: Patobiología Molecular Marina; Química de Productos Marinos.

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-11

El pulpo común (Octopus vulgaris) es una de las especies marinas de mayor importancia económica en el mundo, muy apreciada como alimento y actualmente objeto de una pesca extractiva activa. Su cultivo tiene un gran potencial en la diversificación de la acuicultura y recientemente se ha cultivado con éxito en sistemas experimentales. Muchas de las partes del cuerpo de las especies marinas se eliminan antes de llegar al consumidor final como subproductos para mejorar la conservación, reducir el peso del envío y aumentar la calidad del producto. Los subproductos comunes del pulpo han atraído mucho la atención recientemente, debido al descubrimiento de la presencia de varios compuestos bioactivos relevantes. En particular, en la mucosidad de la piel, así como en la tinta, han sido descritas propiedades antimicrobianas y antioxidantes entre otras, jugando un papel crucial en el mecanismo de defensa animal y actuando como barrera contra una amplia variedad de agentes de estrés (químico, físico y biológico).

Estudios previos llevados a cabo en nuestro grupo utilizando aproximaciones proteómicas shotgun seguidas de análisis bioinformáticos in-silico, han permitido la identificación de péptidos bioactivos en el moco de la piel y la tinta del pulpo común. Proponemos un estudio de selección de esos potenciales biopéptidos y de síntesis de biomoléculas candidatas seguido de un análisis funcional para evaluar la capacidad de estos péptidos como agentes antibacterianos, antivirales y antitumorales. Para ello, se utilizarán los péptidos sintéticos seleccionados para llevar a cabo ensayos mirobiológicos in vitro, estudios de actividad enzimática antioxidante, así como ensayos de proliferación celular y quimiotácticos. Conseguir una aplicación para los descartes de la pesca/cría de pulpo, contribuirá significativamente a cumplir los objetivos de pesca y acuicultura sostenibles y será de interés para la identificación de nuevos subproductos marinos con propiedades farmacológicas bioactivas.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de grado en Biología, Biología Marina, Biotecnología o Bioquímica. La experiencia previa en genómica será valorada. Se requiere una nota mínima de 8.00.

Contacto: mcosta@iim.csic.es; cgestal@iim.csic.es; mcarrera@iim.csic.es

Supervisan: Natalia Petit Marty, Laura Casas y Fran Saborido Rey.

Grupo: Ecología y Recursos Marinos.

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-12

El objetivo principal de este trabajo de máster es poner a punto una innovadora metodología que permitirá obtener estimas de diversidad genética en especies marinas usando muestras de agua. El ADN ambiental de muestras de agua de mar contiene ADN de diferentes especies, pero también de diferentes individuos de una misma especie. De esta manera, esta técnica potencialmente ofrece la posibilidad de evaluar tanto la diversidad de especies como la diversidad genética dentro de especies. En este proyecto usaremos el gen mitocondrial Citocromo C oxidasa subunidad I (COI) que ha sido ampliamente usado para análisis filogenéticos (diferentes especies), como en genética de poblaciones (diversidad genética dentro de especies). Además, actualmente se dispone de técnicas de secuenciación que permiten obtener secuencias completas (ej. PacBIO long-reads sequencing) del COI (haplotipos) y de esta manera estimas de diversidad genética de las especies contenidas en una muestra ambiental (metagenomas). El proyecto consta de una parte de trabajo de laboratorio: extracción de ADN, amplificación por PCR del COI de diferentes individuos y especies de peces que serán usados como controles; y una parte bioinformática que involucrará procesar las secuencias obtenidas de la secuenciación del ADN ambiental.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de grado en una materia relevante (i.e. Grado en Biología, Biología Marina, Bioinformática). Se valorará conocimientos básicos de técnicas moleculares (extracción de ADN, PCR) y/o conocimientos básicos de bioinformática (Blast). Se requiere una nota mínima de 7.00.

Contacto: npetit@iim.csic.es; lauracasas@iim.csic.es; fran@iim.csic.es

Supervisan: Natalia Petit Marty, Laura Casas y Fran Saborido Rey.

Grupo: Ecología y Recursos Marinos.

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-13

El objetivo principal de este trabajo de máster es mejorar la anotación de las secuencias codificadoras de proteínas en el nuevo genoma de la merluza (Merluccius merluccius) que se está produciendo actualmente desde nuestro grupo de investigación. Si bien el número de genomas secuenciados ha crecido exponencialmente en los últimos años, aún existe una gran diferencia entre la disponibilidad de secuencias de genomas completos y los genomas completos anotados con algún grado de confiabilidad. La secuenciación de transcriptomas de diferentes tejidos mejora significativamente la anotación de los genomas, brindando más veracidad y confiabilidad a los análisis que se realizarán a posteriori con éstos. Especialmente, los análisis relacionados con adaptación de las especies de peces a diferentes ambientes requieren un nivel más fino de anotación de las secuencias codificadoras de proteínas debido al elevado grado de duplicación génica que han experimentado los genomas de los peces óseos durante su evolución. Este proyecto se enmarca dentro de la Acción Marie Curie FishAdapt que tiene como objetivo evaluar el potencial adaptativo al cambio climático en especies de interés pesquero.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de grado en una materia relevante (i.e. Bioinformática, Genética o afines). Se valorará un nivel básico de conocimientos de Genómica y Bioinformática (Bases de Datos, Blat/Blast). Se requiere una nota mínima de 7.00.

Contacto: npetit@iim.csic.es; lauracasas@iim.csic.es; fran@iim.csic.es

Supervisan: Gabriela Ojeda Romano y José Pintado Valverde.

Grupo: UCC+i (Unidad de Cultura Científica y de la Innovación)

Referencia de la oferta: JAEICU-21-IIM-14

El impacto de la investigación debe traducirse en beneficios económicos, ambientales, sociales y culturales que contribuyan al progreso y la transformación social hacia escenarios más sostenibles y territorios más resilientes. En el campo de las ciencias marinas, la promoción de la cultura oceánica, la cultura científica y las prácticas participativas entre los agentes sociales y otros colectivos, son elementos esenciales para catalizar el potencial transformador del conocimiento científico. Sin embargo, las intervenciones exitosas necesitan un lenguaje común y un marco teórico base que permita optimizar el flujo de conocimiento y la apropiación social de la investigación. El/la candidata/ha seleccionado/a contribuirá a cerrar la brecha entre el sistema de I+D+i y la sociedad, ayudando a conceptualizar un Marco de Gestión del Conocimiento Marino transversal y específicamente adaptado a las singularidades del entorno sociocultural, económico, institucional y de innovación de la Comunidad Autónoma de Galicia. Enfocado en el patrimonio cultural gallego relacionado con la pesca, este trabajo incluirá una revisión exhaustiva de la literatura y la implementación de metodologías deliberativas para identificar las bases del conocimiento tradicional a incluir en el Marco de Gestión del Conocimiento Marino a desarrollar.

Requisitos: Las personas solicitantes deben estar en posesión de un título de grado en Biología, Biología Marina, Ciencias Ambientales, Ciencias Sociales, Periodismo o cualquier otra disciplina relevante. Se requiere una nota mínima de 7.00.

Contacto: gojeda@iim.csic.es; pintado@iim.csic.es