Historia vital
El servicio de Historia Vital reúne en un mismo espacio todo el equipamiento necesario y el personal especializado en diversas técnicas para analizar distintos parámetros del ciclo de vida de peces y otras especies marinas.
Objetivos y tareas
El servicio de Historia Vital ofrece la recogida y procesado de muestras y permite el acceso a las instalaciones para que las propias personas interesadas puedan procesar sus muestras, siempre bajo el estricto cumplimiento de la normativa de uso del servicio. El servicio se estructura en torno a siete áreas:
- Histología: producción de bloques y portaobjetos de tejidos con y sin tinción para hacer secciones con microtomo. Está especializado en secciones en parafina (hasta 3,5 μm) y en la tinción rutinaria de gónadas de peces con hematoxilina-eosina. También se pueden ofrecer bajo petición previa servicios de inclusión en resina y sección, así como otros métodos de tinción. El laboratorio de histología cuenta con un procesador Leica TP 1020, un sistema de inclusión Leica EG 1160, un microtomo Leica RM 2155, un sistema de tinción Leica XL Autostainer, dos estufas Memmert, campanas de gases, dos armarios para productos químicos y un almacén de productos químicos para guardar las muestras fijadas en formol.
- Parámetros reproductivos: estimación de parámetros reproductivos de peces. Se especializa en la determinación por microscopía del sexo, la maduración, el ciclo sexual, la estrategia reproductiva y la fecundidad (esta última determinada tanto por el método estereológico como por el gravimétrico). El laboratorio está equipado con un microscopio Leica Z6 APOA acoplado a una cámara digital Leica DFC490, un microscopio óptico Leica DMRE con platina motorizada acoplado a una cámara digital Leica DFC320 y un microscopio de fluorescencia Leica DM 5500B con platina motorizada acoplado a una cámara digital Leica DFC310FX.
- Bioenergética: cuantificación de energía (en calorías o kilojulios) por calorimetría en distintos tipos de tejidos de organismos marinos. Estimación de calidad en huevos de peces por calorimetría o peso seco. El laboratorio de bioenergética está equipado con una bomba calorimétrica Parr 6300 conectada a un PC para descarga de datos, dos estufas Memmert y una estufa Selecta.
- Esclerocronología: determinación de edad (en años) en otolitos de peces en estado natural, tostados y quemados, tanto en secciones como sobre la estructura completa. El laboratorio de esclerocronología cuenta con dos microscopios estereoscópicos Leica MZ6 acoplados a cámaras digitales Leica DFC290HD y Leica IC80HD, así como con un microscopio estereoscópico Leica EZ4 HD.
- Análisis de imagen: medida, cuantificación y análisis de estructuras de secciones histológicas de gónadas de peces; estimación de la fecundidad por el método autodiamétrico. Estudios de dendrocronología en otolitos de peces. Generación de imágenes multifocales. Generación de imágenes microscópicas en mosaico de alta resolución. Procesado de imágenes de fluorescencia. El servicio cuenta con los programas de software Leica Q-Win 3.4, LAS v4.1 (módulos: Macro Editor, Advanced Analysis, Store and Recall, Multistep, Macro Runner, Interactive Measurement, Live Measurement, Multifocus y Extended Annotation), Govocitos 2.1., AnalySIS, COFECHA y ARSTAN.
- Ecología espacial con telemetría acústica: todos los aspectos de la biología y ecología de las especies animales se desarrollan en el espacio. Por tanto, el estudio de los patrones espaciales de los procesos ecológicos es vital para alcanzar una gestión eficaz y sostenible de los recursos, como también lo es la integración del componente espacial y comportamental en el enfoque ecosistémico de la evaluación y gestión de pesquerías. El servicio cuenta con el equipamiento y los conocimientos necesarios para llevar a cabo estos estudios en organismos marinos mediante técnicas de telemetría acústica.
- Ecología molecular: metodologías de secuenciación de ADN de nueva generación y de alto rendimiento (HTS), incluidas las metodologías close-kin mark-recapture, RAD-Seq, determinación de la edad por epigenética y herramientas de genómica y transcriptómica de ADN ambiental para desvelar los mecanismos moleculares subyacentes a la plasticidad y diversidad en peces, así como para profundizar en los mecanismos ecológicos y evolutivos a distintos niveles funcionales: de ecosistema, de comunidad y de individuo.
Catálogo de servicios
- HISTOLOGÍA
- ESCLEROCRONOLOGÍA EN PECES | DETERMINACIÓN DE LA EDAD Y DEL CRECIMIENTO DIARIO O ANUAL
- ESTIMACIÓN DE FERTILIDAD EN PECES MEDIANTE ANÁLISIS DE IMAGEN
- IDENTIFICACIÓN MOLECULAR DE ESPECIES
- PREPARACIÓN DE BIBLIOTECAS GENÓMICAS Y TRANSCRIPTÓMICAS
- ULTRASECUENCIACIÓN | ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE EXPRESIÓN GÉNICA DIFERENCIAL Y PROCESAMIENTO ALTERNATIVO DE EXPERIMENTOS DE ARN-seq
- ASISTENCIA BIOINFORMÁTICA EN PROYECTOS DE GENÓMICA Y PROTEÓMICA
Equipo
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LauraCasasCastañoInvestigador/a postdoctorallauracasas@iim.csic.es986 23 19 30 ext. 438523
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MariñaFabeiroQuinteiroPersonal técnico de apoyofabeiro@iim.csic.es986 23 19 30
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EliaLópezIglesiasPersonal técnico de apoyoelopez@iim.csic.es986 23 19 30
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SoniaRábadeUberosPersonal técnico de apoyosoniaru@iim.csic.es986 23 19 30 ext. 438525
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FranSaboridoReyInvestigador/a Principalfran@iim.csic.es986 23 19 30 ext. 438522
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NairVilasArrondoPersonal técnico de apoyonvilas@iim.csic.es986 23 19 30
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DavidVillegasRíosInvestigador/a postdoctoraldvillegas@iim.csic.es986 23 19 30 ext. 438586